Атомарность - разбиение чего либо на логические сущности. Плохо писать лапшекод, хорошо всё разбивать на функции. Того же принципа надо придерживаться в организации структуры приложения (разбиение на модули, директории и т.д.).

Меня раздражало, что CSS стили для разных блоков сайта пишутся в одном styles.css. Написал небольшой модуль на Go, суть работы которого следующая: указывается родительская директория, в которой находятся CSS файлы, далее эта директория и все ее поддиректории рекурсивно обходятся, все CSS файлы собираются в один общий. Есть возможность передать список имен файлов/директорий, которые будут игнорироваться (стили из них не будут добавлены в выходной файл).

Эту штуку назвал cssmerger. Взять можно тут: git.hikan.ru/serr/cssmerger